2004年2月23日，对阵老鹰队获得职业生涯单场得分最高41分和最高助攻7次。
2004-05年，姚明迎来了他在nba的第三个赛季。
2004年夏天，在与奥兰多魔术队的一次七人大交易中，火箭队签入特雷西·麦格雷迪，同时送出史蒂夫·弗朗西斯和卡蒂诺·莫布里。
尽管姚明表示弗兰西斯和莫布里“在（他）前两个赛季对（他）帮助很大”，但他补充到，“我很兴奋能同特雷西麦格雷迪并肩作战。他能带来惊喜。”
火箭队赢得51场比赛，西部排名第五，并连续第二年冲进季后赛。
季后赛遭遇达拉斯小牛队，火箭队客场先胜两场，姚明第二场14投13中，创下火箭队史上季后赛最高投篮命中率。
然而接下来4场火箭队不敌小牛队，第七场更是落后40分，这是nba历史上季后赛第七场的最大分差。
姚明平均每场214分，投篮命中率65%，77个篮板球。
2005年3月11日，对阵太阳队得到职业生涯单场最高篮板22个。
在他的前两个赛季中，他没有缺席任何一场比赛；在第三赛季仅缺席2场。
但是在第四赛季中，姚明被列入伤病休息名单中，原因是他的左脚拇趾患严重的甲沟炎。
2005年12月18日，当队友们在洛杉矶与湖人队客场厮杀时，姚明返回休斯敦进行脚趾手术。
在错过了21场比赛之后，姚明重新回到了赛场，并在与孟菲斯灰熊队的比赛中得15分。
在2006年的全明星赛第二轮投票过后，姚明以1，319，868票高居榜首，科比·布莱恩特以1，213，387票位居第二。
2006年11月14日，对阵马刺获得职业生涯最高抢断次数4次；12月16日，对阵湖人获得职业生涯最高盖帽8个。
这个赛季姚明场均得到25分、94个篮板和2个封盖，得分首次超过麦迪。
但由于在与洛杉矶快船队的比赛中胫骨受伤，姚明这个赛季常规赛出场仅为48场。
在季后赛中，他场均贡献251分、103篮板，不过火箭队还是以3比4不敌犹他爵士队止步季后赛第一轮。
2008年2月26日，在率领休斯敦火箭队获得12连胜之后，被诊断舟骨裂缝，手术后需要休息4个月，07-08赛季剩余将无法出场，随后火箭队在麦迪带领下，继续赢下10连胜，创造nba历史最长连胜纪录的第二位。
姚明在该球季出赛55场，平均取得22分，10个篮板及2个封盖。
这个赛季姚明场均贡献197分、99篮板和19封盖。
另外，他的赛季总得分达到了职业生涯最高的1，514分。
他顺利带领火箭进入季后赛，并首轮淘汰波特兰开拓者队，火箭队在时隔多年后再次进入季后赛第二轮。
值得一提的是，姚明在首轮对阵开拓者队的第一场中，上半场24分钟内，9投9中，6罚6中得到24分和9个篮板。
不过在第二轮对战洛杉矶湖人队的比赛中，姚明因脚伤导致休战，甚至影响了2009-10赛季。
2009年1月18日，对阵热火12投12中拿到26分。
2009年3月14日，对阵山猫投中赛季第1个3分。
2009年4月19日，对阵开拓者姚明在24分钟内9投9中得到24分。
5月5日，对阵湖人的西部半决赛第一场中受伤，但经过调整后执意冲回赛场，并最终带领火箭取得胜利。
5月10日，左脚骨裂，该赛季报销。7月，他成为上海大鲨鱼俱乐部老板。
2010年11月11日，伤愈复出不久的姚明在同奇才队的比赛中再度受伤，随后一直休战。
12月18日，火箭官方宣布姚明左脚踝第三次应力性骨折，赛季报销。
2015年12月21日，火箭队正式提名姚明入选2016年的篮球名人堂。
2016年，姚明入选nba名人堂，成为中国第一人。
2017年2月4日，休斯敦火箭队举行姚明球衣退役仪式。
姚明成为火箭队史上第6位享受球衣退役殊荣的球员。
之前的5人分别是德雷克斯勒(22号)、凯尔文·墨菲(23号)、摩西·马龙(24号)、奥拉朱旺(34号)以及汤姆贾诺维奇(45号)。
姚明被公认为nba最全面的中锋。
他的身高是一个显著的优势：他可以轻松的在防守队员头上投篮。
他可以在20英尺外精确跳投（在cba时期和nba时期他都曾投进过三分球）。
但是他的投篮主要集中在距离篮筐10-12尺的范围内，通过勾手投篮、转身投篮和灌篮得分。他的罚球命中率高达80%，在联盟中锋中数佼佼者。
他甚至可以自己运球到中场，并且作为一个高个球员，他的篮球基本功和传球技能相当优异，球场视野和赛场感觉十分出色。
一些人批评他在场上缺少气势并且体力不够充沛。
但是，姚明却被公认为非常有团队精神，他经常放弃自己投篮的机会而传球给队友。
相比其他明星队友来说，他的投篮次数并不高，因此也就限制住了他平均每场的分数。
他的投篮命中率是令人印象深刻的，在2004-2005赛季，他的投篮命中率在全nba排名第三，2010年姚明的身价已达10亿美元。
姚明的商业活动主要分为三类：一是，商业代言；二是，投资；三是授权业务。
但除代言收入，姚明目前的投资中盈利的项目很少，而授权业务几乎尚未起步。
防守方面，姚明的身高无疑是对对手的震慑，尽管不少人认为他的身材还不够结实。
尽管他是联盟中数一数二的防守中锋，许多人批评说以他的身高，姚明的封盖数据统计应该更好（第三赛季前，他的每场封盖数在2个以下）。
一些分析家将此归咎于姚明的翼展，不同于其他运动员，他的翼展比他的身高要短一些。但是，姚明的翼展依旧比平均水平要长很多。
由于火箭队采用慢节奏的进攻模式，姚明其实并没有太多时间发挥，这导致了他的技术统计不高。
在赛场上，姚明并不总是停留几个固定位置上，火箭队移动防守的战术需要姚明的积极参与。